Stitch est enfin de retour chez lui, à Hawaï. Bien sûr, c'est à ce moment-là qu'un autre vaisseau spatial atterrit dans son jardin, mais cette fois, c'est Lilo que les extraterrestres veulent rencontrer ! Il s'avère que le succès de Lilo auprès de l'imprévisible Expérience 626 a fait d'elle l'experte incontournable de la Fédération Galactique en matière de contrôle de créatures, et ils ont encore quelques cas épineux à lui confier. Mais même avec l'aide de Stitch, Nani et du Dr Jumba, Lilo (ou la Terre elle-même) parviendra-t-elle à se débarrasser des créatures les plus destructrices de la galaxie ?