Judy Hopps et Nick Wilde ont sauvé Zootopie et ses habitants, mais ils ne comptent pas s'arrêter en si bon chemin. Prêts à servir et à protéger la ville, la lapine et le renard forment désormais un duo soudé au sein de la police. Leur seul obstacle semble être le chef Bogo, qui persiste à leur confier des missions sans intérêt.

Pourtant, la monotonie de leur quotidien est troublée par une série d'événements étranges. Entre sabotages suspects et vols inhabituels, qui vient semer le trouble à Zootopie ? À Nick et Judy de mener l'enquête !