Les Tortues Ninja ont été séparées suite à une explosion. Raph a été projeté dans le canal et repêché par les membres des Dragons Pourpres, un gang de criminels, qui le retiennent prisonnier. Mais ce n'est pas tout : un Méchazoïde est sur ses traces ! Raph parviendra-t-il à se sortir de cette situation sans l'aide de ses frères ?