Sur Dune, le temps de l'accomplissement des anciennes prophéties est venu. La transformation écologique s'accélère : l'eau, jadis plus coûteuse que l'or, coule à flots, et la végétation s'étend sur la surface de la planète, menaçant les vers des sables et la précieuse Épice.
En partant dans le désert pour mourir, conformément à la tradition fremen, Paul-Muad'Dib a laissé ses jumeaux Leto et Ghanima affronter seuls leurs ennemis, qu'ils viennent de l'extérieur... ou du plus profond d'eux-mêmes. Il devront déjouer leurs complots s'ils veulent survivre et refondre l'univers humain ébranlé par le Jihad avant de régner à leur tour sur Dune.