Ryo Saeba, de l'agence City Hunter, est un ancien guérillero, reconverti en nettoyeur. Travaillant sur demande, il débarrasse Tokyo de criminels en tout genre. Tireur d'élite hors pair, il est le plus souvent engagé comme garde du corps pour des missions des plus dangereuses. Avec sa partenaire Kaori, avec laquelle il entretient une relation atypique, ils forment un duo d'enfer que rien ne peut arrêter. Et quand il ne chasse pas les criminels, il court les jolies filles... ce qui est parfois tout aussi dangereux.