Alors que l'agent Stitch et ses amis pensent que la Terre est à l'abri d'une invasion extraterrestre, une nouvelle menace apparaît : un adversaire aquatique connu sous le nom de Glubglubs ! Avec l'aide d'un vieil ennemi devenu allié, Stitch, Lilo, Jumba et Pickly doivent se rendre à Paris et à Londres pour mettre fin à l'effroyable déferlement d'ennemis !